大学院での学びは、以下の２つの選考に分かれることになります。これは、より専門的な学問的知識を身につけるためです。しかし、同時に、広い視野を獲得するために、他専攻からも一定の単位数の履修が義務付けられています。

聖書神学専攻

　聖書神学専攻は、新約聖書学、旧約聖書学の諸科目を中心として、アラム語、シリア語などの語学学習を含む。修士課程２年次には、修士論文の作成を行うが、そのための修士論文指導演習も設けられ、きめの細かい教育がなされている。神の言として教会が語り伝えてきた聖書を、それが書かれた歴史の背景の中で読み直すとともに、聖書の原典にあたりながら、釈義する方法をもあわせて修得する。

博士課程前期課程科目

●旧約神学関係 　旧約聖書原典講読�T・�U、旧約聖書原典釈義�T・�U、旧約聖書神学特講�T・�U、旧約聖書学特研�T・�U 　旧約聖書学演習�T・�U、聖書考古学、アラム語、シリア語、アッカド語、古代オリエント史�T・�U 　修士論文指導演習旧約神学�T・�U

●新約神学関係 　新約聖書学特講�T・�U、新約聖書学演習、新約聖書学特研�T・�U、新約聖書原典釈義�T・�U 　修士論文指導演習新約神学�T・�U

●専攻間共同科目 　共同演習、アジア伝道論演習、日本伝道論演習

●実践神学研修課程 　礼拝学演習、説教学演習�T・�U・�V、牧会学演習、総合特別講義

博士課程後期課程科目

●旧約神学関係 　旧約聖書神学特殊研究、旧約聖書文学特殊研究、旧約聖書原典特殊研究、聖書語学特殊研究、聖書考古学特殊研究

●新約神学関係 　新約聖書神学特殊研究、新約聖書原典特殊研究、聖書解釈学特殊研究、原始キリスト教特殊研究

●博士論文指導演習聖書神学

組織神学専攻

　組織神学専攻では、組織神学、歴史神学、実践神学の諸科目を中心として、体系的な神学研究を行う。聖書神学専攻と同じく、修士課程２年次に修士論文作成が課せられるが、そのための修士論文作成のための演習も充実している。組織神学専攻では、キリスト教の教理の体系化、さらに教理の真理性の弁証、古代から現代に至る神学思想の理解、さらに歴史的な文脈における教会や教理の理解、キリスト教教育、牧会学、説教学、現代の教会でのそれらの実践的課題などが研究対象となる。

博士課程前期課程科目

●組織神学関係 　組織神学特講�T・�U、組織神学特研�T・�U、組織神学演習�T・�U・�V、信条学、修士論文指導演習組織神学�T・�U

●歴史神学関係 　教会史演習、教理史演習�T・�U、教会史特講�T・�U、教理史特講�T・�U、英国教会史、修士論文指導演習歴史神学�T・�U

●実践神学関係 　宗教社会学演習、教会音楽、キリスト教教育特講、牧会心理学特講、牧会カウンセリング特研、キリスト教教育特研 　実践神学演習、臨床牧会教育、牧会心理学

●専攻間共同科目 　共同演習、アジア伝道論演習、日本伝道論演習

●実践神学研修課程 　礼拝学演習、説教学演習�T・�U・�V、牧会学演習、総合特別講義

博士課程後期課程科目

●組織神学関係 　教義学特殊研究、現代神学特殊研究、宗教改革神学特殊研究、現代哲学特殊研究、組織神学共同演習 　キリスト教社会倫理特殊研究

●歴史神学関係 　神学史特殊研究、宗教改革史特殊研究、日本宗教思想史特殊研究、教父学特殊研究

●実践神学関係 　キリスト教教化学特殊研究、キリスト教教育特殊研究

●博士論文指導演習組織神学